Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccer1Q9CQL2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccer1Q9CQL2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccer1Q9CQL2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms