Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms