Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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