Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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