Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms