Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms