Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt23Q99PS0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt23Q99PS0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms