Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup155Q99P88 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms