Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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