Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms