Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprtQ99M80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms