Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms