Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smim11aQ99J19 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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