Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms