Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps3Q91VB4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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