Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Smg8Q8VE18 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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