Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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