Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms