Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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