Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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SbsnQ8CIT9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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