Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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