Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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