Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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