Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9949Q8C9F4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms