Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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