Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sfrp1Q8C4U3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sfrp1Q8C4U3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sfrp1Q8C4U3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms