Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Atg16l1Q8C0J2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Atg16l1Q8C0J2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Atg16l1Q8C0J2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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