Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccser1Q8C0C4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccser1Q8C0C4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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