Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdcl3Q8BVF2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms