Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Me3Q8BMF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Me3Q8BMF3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms