Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms