Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms