Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htatsf1Q8BGC0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms