Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms