Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc50Q810U5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms