Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
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