Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Actn1Q7TPR4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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