Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrc2bQ7TPM1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrc2bQ7TPM1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms