Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms