Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms