Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ecm29Q6PDI5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms