Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms