Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg9bQ6EBV9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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