Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg9aQ68FE2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg9aQ68FE2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg9aQ68FE2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg9aQ68FE2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms