Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms