Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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