Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrrn1Q61809 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms