Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms