Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp7Q60973 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms