Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms